حسن خمینی، نوه روح الله خمینی که پیشتر با توصیه خامنهای، از داوطلب شدن برای انتخابات منصرف شده بود، شورای نگهبان را متهم کرد که با رد صلاحیت گسترده “تیشه به ریشه انقلاب” زده و هشدار داد که “هر حرکتی که بخواهد نافی عنصر جمهوری باشد یک حرکت ضد انقلابی است.”
حسن خمینی، با توجه به انتشار لیست نهایی افراد تایید صلاحیت شده توسط شورای نگهبان گفته است: اگر من به جای کاندیداهای تایید شده بودم انصراف می دادم چراکه دولت برآمده از این انتخابات توان حل هیچ مشکلی را ندارد.»
حسن خمینی که به عنوان رئیس موسسه حفظ و نشر آثار خمینی بودجه میلیاردی دریافت میکند، افزوده: «آقایان یک لحظه از کسوت خود بیرون آیند؛ آیا عملکرد خود را می پذیرند؟ هر حرکتی که نافی عنصر جمهوریت باشد، حرکت ضدانقلابی است مگر می شود نظام همان نظام امام باشد و مردم در آن حق نداشته باشند؟ اینکه کسی بگوید اگر مردم نیایند هم مشروعیت نظام باقی است ناشی از نشناختن روح و ماهیت جمهوری اسلامی است.»
اشاره حسن خمینی به سخنان سه روز قبل کدخدایی، سخنگوی شورای نگهبان است که گفته بود عدم شرکت مردم هیچ تاثیری بر مشروعیت انتخابات ندارد.